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科技進(jìn)展
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近日,中科院大連化學(xué)物理研究所分子反應(yīng)動(dòng)力學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1101組韓克利研究員及其成員撰寫的綜述文章“Recent density functional theory model calculations of drug metabolism by cytochrome P450”發(fā)表在Coordination Chemistry Reviews上(Coord. Chem. Rev., DOI: 10.1016/j.ccr.2012.01.016, 2012, in press)。

細(xì)胞色素P450(簡(jiǎn)稱P450)是生物體內(nèi)的一類單加氧酶,其催化功能非常廣泛,臨床上大多數(shù)藥物的I相代謝都是由P450催化的。在參與外源性物質(zhì)的代謝過程中,P450既能發(fā)揮其解毒作用,又能將某些外源物轉(zhuǎn)化為有毒物質(zhì),因此研究P450催化外源性底物代謝的反應(yīng)機(jī)理在藥物開發(fā)初期具有十分重要的意義。

P450被認(rèn)為是自然界中最具催化多樣性的生物催化劑,它可以催化多種反應(yīng),如C-H羥基化、C=C環(huán)氧化、雜原子氧化、芳環(huán)氧化、脫烷基等。在催化反應(yīng)過程中,分子氧(O2)裂解,P450將其中一個(gè)氧原子插入到底物(substrate, S)中,生成產(chǎn)物SO和水。

大連化物所1101組自2006年以來一直致力于細(xì)胞色素P450催化反應(yīng)機(jī)理的理論研究,并相繼在J. Phys. Chem. B、ChemBioChem、J. Biol. Inorg. Chem.、Dalton Trans.、J. Am. Chem. Soc.等雜志上發(fā)表了一系列文章。該綜述介紹了1101組研究的P450催化的乙醇氧化、乙醛氧化、胺類脫烷基、酰胺脫烷基、尼古丁氧化等一系列反應(yīng)。其中,乙醇氧化研究提出了一個(gè)新的反應(yīng)通道(R-DHA),很好地解釋了隨著血醇濃度升高乙醇代謝增強(qiáng)的現(xiàn)象;乙醛氧化是一個(gè)協(xié)同氧化的過程,其C-H鍵的活化能僅為烷烴類活化能的1/3~1/2;胺類脫烷基反應(yīng)的研究解決了HAT-SET機(jī)理的爭(zhēng)論,給出了一個(gè)一致性的機(jī)理繪景;酰胺中羰基的引入使酰胺有別于胺類,其所表現(xiàn)出的一些實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象也與胺類有明顯區(qū)別,酰胺脫烷基反應(yīng)的研究很好地解釋了這些實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象;尼古丁氧化研究分別計(jì)算了尼古丁5’-羥基化反應(yīng)和N-脫甲基反應(yīng),對(duì)反應(yīng)的區(qū)域選擇性給出了合理的解釋。以上理論研究將為合理設(shè)計(jì)藥物提供一定的理論基礎(chǔ),對(duì)藥物開發(fā)具有一定的指導(dǎo)意義。 

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