日前，由中科院海洋所宋林生研究員課題組承擔的“河鲀雜交優(yōu)勢機制的轉錄組解析”研究取得重要進展，相關研究成果在PLoS ONE上發(fā)表。
科研人員依托基因資源研究平臺，使用SOLiD 4第二代高通量測序儀，通過對紅鰭東方鲀、菊黃東方鲀及其雜交后代“冀研一號”的全轉錄組測序分析，獲得了總長超過12 Gbp的序列，覆蓋44,305個轉錄本。同時，科研人員還對14,148個差異表達轉錄本進行比較分析，初步確定了超過兩千個雜交優(yōu)勢候選基因，得到了35條與雜交優(yōu)勢有關的KEGG通路，發(fā)現(xiàn)“冀研一號”的基因表達模式分別符合顯性效應、超顯性效應及累加效應，由此推測“冀研一號”的雜交優(yōu)勢是由多種效應共同存在所決定的，證明了雜交東方鲀中存在大量的新轉錄剪切形式，具有離子結合、核酸結合及激酶催化等多種功能，這些新發(fā)現(xiàn)的轉錄剪接體同樣可能與雜交優(yōu)勢密切相關。
該項研究完全依托中科院海洋所自主構建的海洋生物基因資源平臺和超算平臺獨立完成，獲取的轉錄組信息，為從基因調控網(wǎng)絡的角度理解雜交優(yōu)勢形成和調節(jié)機制提供了重要數(shù)據(jù)資源，也為雜交優(yōu)勢的應用提供了理論指導。
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http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0058453
