近日，中科院大連化學物理研究所王方軍博士、鄒漢法研究員等人在高通量多重蛋白質(zhì)組定量分析方法研究方面取得新進展，發(fā)展了一級質(zhì)譜（MS1）譜圖中六種不同蛋白質(zhì)樣品同時規(guī)?；糠治龅耐凰貥擞浄椒?，并將該方法應用于細胞蛋白質(zhì)合成-降解周轉(zhuǎn)更新分析，分析通量是常規(guī)同位素標記方法的三倍，研究成果發(fā)表在自然出版社新創(chuàng)立的綜合性刊物《科學報告》上（Scientific Reports, 2013, 3, 1827. doi: 10.1038/srep01827, http://www.nature.com/srep/2013/130510/srep01827/full/srep01827.html）。
基于一級質(zhì)譜（MS1）的蛋白質(zhì)組學定量分析由于定量精度高，是現(xiàn)今蛋白質(zhì)組學定量分析中應用最為廣泛的分析技術。由于同位素標記的限制，現(xiàn)有的方法最多可以在一次液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用分析中定量三種不同的蛋白質(zhì)樣品，極大限制了蛋白質(zhì)組學定量分析的通量。王方軍博士、鄒漢法研究員等人將體內(nèi)氨基酸同位素標記方法與體外二甲基化同位素標記方法進行有機組合，實現(xiàn)了六種不同蛋白質(zhì)樣品的差異標記并在單次實驗中實現(xiàn)了相對定量分析。該六重同位素標記策略還可以應用于細胞中蛋白質(zhì)的合成及降解速率的高通量分析，成功測定了HeLa細胞中1365個蛋白質(zhì)的合成-降解周轉(zhuǎn)更新時間。此外，該工作中使用的基于MS1六重蛋白質(zhì)組學定量及蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)分析軟件系統(tǒng)也由我所自主開發(fā)，是國際上首個可以同時定量六個不同蛋白質(zhì)樣品的軟件系統(tǒng)。
Quant-ArMone 六重蛋白質(zhì)組學定量及蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)分析軟件示意圖
HeLa細胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解動態(tài)擬合曲線示例
